L’agrément d’un comité est délivré par le ministre chargé de la santé sur la demande du préfet de la région concernée et après avis de celui-ci. La demande d’agrément mentionne l’adresse du siège social du comité et est accompagnée d’un budget prévisionnel et, pour les demandes de renouvellement, d’un rapport d’activité pour la période écoulée depuis le précédent agrément. Le contenu du budget prévisionnel et du rapport d’activité est fixé par arrêté du ministre chargé de la santé. Les demandes de renouvellement d’agrément sont adressées au plus tard trois mois avant l’expiration de l’agrément en cours.
L’agrément est délivré pour une durée de six ans. L’arrêté du ministre chargé de la santé prononçant l’agrément détermine la compétence territoriale du comité après avis du préfet de la région concernée. Le ministre peut toutefois, sans attendre le renouvellement, modifier la compétence territoriale d’un comité, sur proposition du préfet de la région concernée.
Le renouvellement de l’agrément est prononcé dans les mêmes formes.